Der Sandbox-Titel spielt zu einem Zeitpunkt der japanischen Geschichte, in der Admiral Perry Japans Grenzen für den globalen Handel öffnete. Eine japanische Hafenstadt wehrt sich jedoch mit Waffengewalt dagegen. Die Spieler schlüpfen in die Schuhe eines Samurais, der sich entscheiden muss, auf welcher Seite er kämpft. Auf der Seite der Widerstandsgruppe, auf Seiten der Fremden oder für die Regierung, die um jeden Preis den Frieden bewahren will.