Das neue Videospiel basiert auf dem demnächst erscheinenden Fernsehfilm, der seinerseits auf der Zeichentrickserie beruht. In der Rolle von Phineas, Ferb, Agent P und anderen beliebten Charakteren bereisen die Spieler neue Dimensionen, um dem bösen Dr. Doofenschmirtz Einhalt zu gebieten.

In der PlayStation 3- und Wii-Version können die Spieler in die Rolle von 10 verschiedenen Charakteren schlüpfen. Im Zweispieler-Koop-Modus können sie gemeinsam durch eine Zeichentrickwelt aus dem Jahre 1928 das Land der Gartenzwerge und eine Gelatine-Welt reisen. Um die Welt zu retten, müssen die Spieler 25 Levels sowie zahlreiche Prüfungen bestehen, um neue Gadgets zu erhalten, darunter z.B. ein Karbonator, der Orangenlimonade verspritzt und Gegner einfach weg schmelzen lässt oder Ninja-Handschuhe, mit denen sich die Spieler an Wände heften können.

Unterwegs sammeln die Spieler Gegenstände und schalten weitere spielbare Charaktere frei, darunter einen neuen OOCA-Spezialagenten, der eigens für das Videospiel entworfen wurde. In der PlayStation 3-Version kommt außerdem erstmals in einem Phineas und Ferb-Videospiel die PlayStation Move-Controller-Technologie zum Einsatz.