Dieses bunte Wii U-Spiel macht es sich ebenfalls auf dem Nintendo 3DS bequem. Die portable Version beinhaltet neue Funktionen und alle Level der Wii U-Fassung. Zusätzlich gibt es neue Level für Yoshis Freund Schnuffel: Spieler müssen Schnuffels Sprünge zeitlich so ausführen, dass er Juwelen und Schnuffelchen auf dem Weg zum Ziel einsammelt. Schnuffelchen sind kleine Helfer, die anzeigen, wo Spieler sich nach Geheimnissen und Sammelobjekten umsehen sollten. Nintendo arbeitet außerdem mit dem Stop-Motion-Studio Dwarf zusammen an 30 animierten Kurzfilmen mit Yoshi und Schnuffel, die in der Nintendo 3DS-Version enthalten sein werden. Ein Woll-amiibo von Schnuffel wird es ebenfalls geben es soll zeitgleich mit dem Spiel erscheinen.